琼脂糖凝胶电泳marker的作用是什么？

琼脂糖凝胶电泳marker,也称DNA标记物,其主要作用有:

1. 确定DNA片段大小

marker含有不同大小的DNA片段,在电泳过程中可以按大小进行分离,并在凝胶上形成梯状条带。通过比较样本DNA与marker DNA的迁移距离,可以确定未知DNA的大致大小。

2. 确定电泳过程

通过观察marker DNA的电泳情况,可以判断琼脂糖凝胶电泳是否正常进行,例如电压、时间是否合适。

3. 校验电泳结果

marker DNA条带的位置固定,如果样本DNA的迁移位置不正常,说明可能出现了实验操作错误、样本问题等,需要校验电泳结果。

4. 标定离子前端

marker中含有一定的已知浓度乙硝基类荧光染料,可以在凝胶成像时标定离子前端,以更准确判断DNA片段大小。

5. 标准化不同凝胶

使用marker作为标准,可以在一定程度上标准化不同批次凝胶之间的差异,更准确地比较不同凝胶上的DNA。

6. 定量PCR反应

在定量PCR系统中,marker也可用来绘制标准曲线,用于定量未知模板的起始拷贝数。

综上,marker对凝胶电泳结果的准确性和可靠性都起到非常关键的作用。是进行凝胶电泳必不可少的组成部分。