求一部日本动画，男主研究造成末世，动物超级进化巨型化。

根据您的描述,这部日本动画很有可能是《新世纪福音战士》。

《新世纪福音战士》是一部著名的日本机器人动画,于1995-1996年播出。该作品描绘了一个探讨人性和存在主题的后启示录世界。

故事背景设定在第三次影响(Third Impact),即末日审判过后。主角碇真嗣是NERV机构的驾驶员,驾驶著EVA初号机进行诸如天使般的怪物的战斗。

在剧中,第二次影响(Second Impact)造成南极洲的冰盖融化,海平面上升及气候变化,人类环境遭到破坏。随后动物在此环境下进化成巨型化,海洋生物更进化出怪异而庞大的形态。

同时,一些失去肉体的人类意识也进化成以能量体的形态出现,并展开袭击,为其提供了第一具敌人。这些庞大而强大的生物成为人类的天敌,攻击各地的人类栖息地,主角等人通过驾驶EVA与之战斗。

可以说,《新世纪福音战士》描绘的后世界,是人类环境破坏和各种生物巨型化进化的结果,而主角也深度在此背景下探讨存在的意义。

所以,根据您提供的描述,《新世纪福音战士》很有可能就是您所求的这部日本动画。如果还有其他问题,欢迎继续提问。